杂草之间有相辅相克的自然规律，人类认识了这种规律便可借助这种规律来“以草压草”。现在已经证实了的如种植三叶草、紫花苜蓿、紫云英、苕子等豆科植物，它们都是优势植物，它们生长快，竞争力强，很快能占领空间覆盖地面，所以能排挤其他杂草，并能固氮增加土壤肥力。还有，密播芝麻能压制香附子草；葵花的茎叶浸出液能抑制稗草生长；番木瓜和十字花科植物能产生异硫氰酸酯，对没有萌芽的休眠杂草种子有强抑制发芽的作用；水田放养红萍可抑制水田水生杂草的生长；甘萼藤长满地面时，其他杂草就无法生长，这样为下茬作物准备了无草地面；大麦和青稞所产生的气味能抑制附近杂草生长。
利用动物灭草也是好办法。如稻田放养草鱼，能食尽稻田杂草，誉名为“万能除草器”。利用鹅不食棉花的习性，棉田养鹅除草经济实惠。兔子不食番茄，在番茄地里养兔灭草的方法也不差。还有尖翅小卷蛾能防扁秆薦草（三棱草），豚草条纹叶甲防豚草。
物理灭草方法也管用。如深水淹稗，就是指刚发芽的稗草在稻田时，灌深水，保持一周后稗草得不到阳光便会死去。稻田生长芦苇这种杂草，可等它长到1m高时用重型圆盘耙来回将其切碎成小段，而后打埂灌水，浑水进入芦苇管中，便会死去，或带水翻耕也能灭芦苇。
生态灭草法是利用两种不同的生态环境，以控制杂草的生长。如水旱轮作，这是我国古老的灭草方式，也是现代自然农法运用的模式。一般旱地杂草难以在水田生存，同样水田杂草也一般难以在旱地生长。适应水旱两地生长的杂草为数不多，如芦苇、稗草。其他办法如用正在发酵的鸡粪水有浓烈的氨气，喷在杂草上能熏死杂草。还可利用秋后余热，耙地诱发一年生杂草，严寒来临时它尚在幼苗期，便可将其冻死。
人类经过破坏自然遭到自然报复后的反思，提出了回归自然，保护环境，生产无公害的绿色食品即自然食品，饮用无*的净化水等。如美国在—年多次发生了“黑风暴”，特别是年危害最严重，受害面积达万km，尘土上升2km高。5月12日风沙迷漫，不见天日。据统计，刮走肥沃的表土3亿t，致使当年小麦减产万kg，引起了美国农业科技界的震动。年美国农学家福克勒在纽约出版了《犁耕者的愚蠢》一书，旗帜鲜明地反对翻耕，否定了犁耕的必要性。20世纪70年代美国农业专家韩丁来我国介绍了免耕法，80年代引进了日本福冈式的自然农法，遂引起了我国在耕作制度上一系列改进。现在，具有中国特色初级阶段的自然农法已初具规模。农业部原副部长路明认为，越简单的“傻瓜”技术，其科技含量越高，这符合科学的发展规律，即从简单到复杂，又从复杂到简单。开始人类的原始耕作法“刀耕火种”很简单，一是种，二是收，后来发展到畜耕，最后达到大面积用机耕。在强化耕作下，要经过翻耕、耙地、平地、播前镇压或播后镇压、苗期松土、耙草、多次中耕除草，一般进行三次中耕，收割时还要用秸秆粉碎机，加上播种与收割一共有十一次机械作业（据*国营农场机械作业统计），现在的初级阶段自然农法又回到一是种，二是收了。